Bagaimana Ciri-ciri virus MERS ?

Virus Mers adalah virus yang termasuk dalam kelompok betacoronavirus saat diidentifikasi pada bulan November 2012 ternyata memiliki hubungan kekerabatan dengan coronavirus yang terdapat pada kelelawar yakni jenis HKU4 dan HKU5. Pada akhirnya virus tersebut diberi istilah "hCoV-EMC" yang merupakan singkatan dari Human Coronavirus Erasmus Medical Center . Namun  pada bulan Mei 2013 istilahnya diubah menjadi  Middle  East respiratory syndrome (MERS) coronavirus (MERS-CoV).

MERS-Middle East respiratory syndrome/sindroma pernapasan Timur Tengah adalah nama penyakit saluran pernafasan yang disebabkan oleh salah satu anggota dari keluarga virus korona (coronavirus), yaitu MERS-CoV, untuk memudahkan dalam menyebutnya kita sebut sebagai MERS saja. Diberi nama “korona” (=mahkota) karena virus-virus ini mempunyai struktur yang bentuknya menyerupai mahkota di permukaannya. Anggota keluarga virus korona sebenarnya banyak dan setiap orang mungkin pernah terinfeksi virus korona. Pada umumnya infeksi virus korona menyebabkan sakit pernapasan ringan dengan gejala menyerupai flu, kalau dalam bahasa Inggris disebut common cold. Virus korona ada yang menginfeksi manusia dan ada yang menginfeksi hewan. Satu jenis virus korona biasanya tidak menginfeksi manusia dan hewan, kecuali virus korona yang menyebabkan sindroma pernapasan akut berat, SARS, dan sekarang MERS. SARS dan MERS diketahui menginfeksi binatang dan manusia dengan tingkat kematian yang tinggi.

MERS sebenarnya masih “bersaudara” dengan SARS; keduanya sama-sama CoV, anggota keluarga virus korona. Jadi, baik dari struktur virusnya maupun dari cara penularan dan jenis penyakit yang ditimbulkannya, kita akan melihat banyak kemiripan antara MERS dan SARS, walaupun keduanya adalah virus yang berbeda. Namun, sejauh ini, MERS nampaknya lebih banyak menyerang orang yang sudah menderita penyakit lain sehingga kekebalan tubuhnya berkurang, seperti kegagalan ginjal kronik atau kanker. MERS juga nampaknya lebih cepat menyebabkan kematian dibandingkan SARS, mungkin berhubungan dengan adanya penyakit lain tadi.

Virus MERS  sudah lama beredar di populasi unta di Timur Tengah, jadi bukan hanya satu ekor. Lebih jauh lagi, virus korona sangat umum ditemukan pada populasi kelelawar. Sekali lagi kita belum tahu pasti kalau MERS memang ditularkan dari unta atau hewan lainnya. Terlepas dari itu, virus yang menyerang hewan tidak jarang menyerang manusia juga.

Penularan dapat terjadi terhadap manusia diikarenakan sebagian zoonosis memang mudah menular dari hewan ke manusia karena mereka mempunyai kemampuan menyerang sel-sel manusia sama baiknya dengan kemampuan mereka menyerang sel pada binatang, misalnya karena sel yang mereka serang mempunyai struktur yang sama pada hewan maupun manusia. Jadi penyakit bersumber binatang sebenarnya sudah sangat banyak.

SARS, flu burung, dan mungkin sekarang MERS “hanya” tambahan saja. Dengan kemajuan teknologi, identifikasi virus-virus baru yang menyebabkan penyakit pada manusia menjadi lebih mudah juga. Di lain pihak, interaksi manusia dengan hewan juga semakin tinggi, bukan hanya dengan hewan peliharaan atau ternak, tapi juga dengan hewan-hewan yang “terpaksa” berinteraksi dengan lingkungan hidup manusia karena mereka kehilangan habitatnya.

1.      Genom MERS-CoV

Struktur genom MERS-CoV terdiri dari 30119 nukleotida yang memiliki kemiripan dengan coronaviruses yang lainnya. Materi genetiknya berupa RNA yang memiliki penambahan gugus poli-A pada ujung 3’ mRNA (polyadenylation) dengan 2/3 genomnya mengkode protein non-struktural (NSPs = Non-Structural Proteins) yang terlibat dalam replikasi

Koronavirus adalah virus dari familia Coronaviridae yang dapat menyebabkan penyakit pada manusia, mamalia, dan burung di mana mereka menyebabkan penyakit pernapasan dan enterik. Coronaviruses, berdiameter 100nm, adalah positif virus RNA untai terbesar (memang mereka memiliki genom terbesar dari setiap virus RNA). Struktur tubuh virus (virion) ini terdiri dari membran, selubung lipid bilayer (envelope), glikoprotein yang menyerupai paku (spike), dan protein nukleokapsid. Glikoprotein korona virus dapat berikatan dengan glikoprotein permukaan sel inang secara spesifik untuk memulai terjadinya infeksi. Virus korona bersama dengan toroviruses dan arteriviruses, milik kelompok, nidovirales, yang menghasilkan satu set bersarang mRNA dengan umum 3 'akhir (lihat di bawah). Para coronaviruses dan toroviruses (yang bersama-sama membentuk Coronaviridae) memiliki nukleokapsid heliks sementara arteriviruses memiliki nukleokapsid ikosahedral. Coronaviruses memiliki sebuah amplop yang berasal dari membran intraseluler dan bukan membran plasma. Dalam mikrograf elektron mereka memiliki paku yang mencuat dari permukaan mereka (karena glikoprotein besar), yang mengarah ke nama mereka (corona = crown). Korona virus diklasifikasikan menjadi tiga golongan utama, golongan 1 dan 2 menginfeksi mamalia, mulai dari kelelawar hingga manusia, sedangkan golongan 3 hanya ditemukan pada spesies avian (burung). Infeksi virus ini dapat menimbulkan gejala penyakit yang bervariasi, mulai dari hampir tidak timbul gejala apapun hingga gejala yang fatal dan cepat. Infeksi koronavirus dapat menyebabkan berbagai penyakit, seperti bronkitis, ensefalitis, gastroenteritis, dan hepatitis.

2.      Protein MERS-CoV

a)   S (spike) protein (150K)

Ini adalah glikoprotein transmembran dengan tiga domain, yaitu domain eksternal yang besar (dengan dua sub domain), urutan transmembran dan domain internal kecil. Domain eksternal (N-terminal) lipatan ke luar membentuk globular dan membentuk struktur lonjakan mikrograf elektron. Wilayah ini memberikan virus sifat antigenik dan berisi situs pengikatan untuk reseptor permukaan sel. Bagian dalam dari domain eksternal mungkin melingkar-coil dan berisi mengulangi heptad. Ada lemak asil molekul di sini yang dapat menstabilkan protein di lapisan ganda lipid. Bagian dalam dari domain eksternal membentuk struktur seperti tangkai yang berasosiasi dengan protein S lain untuk membentuk trimer. Dalam beberapa coronaviruses, domain eksternal dibelah tetapi dua bagian glikoprotein tetap berhubungan dengan interaksi ion (dalam cara yang mirip dengan gp120 dan gp 41 HIV). Bagian dalam dari protein S, yang mungkin terkena mengikat sel inang, bertanggung jawab untuk fusi membran. Menariknya, protein S memiliki wilayah yang mirip dengan reseptor Fc-gamma untuk imunoglobulin memungkinkan virus untuk melapisi dirinya dengan protein ini dan melindungi diri dari serangan kekebalan tubuh (virus herpes memiliki strategi yang sama). Dapat mengikat protein S menja asam sialic (9-O-asetil asam neuraminic) pada permukaan sel inang yang memberikan virus kemampuan hemagglutinating. Antibodi terhadap protein S yang menetralkan.

b)  HE (65kD) protein

Hanya beberapa coronaviruses  yang memiliki protein hemagglutinin-esterase. Hal ini juga membentuk paku (lebih pendek dari S paku) pada permukaan virus. Protein ini juga mengikat asam sialat. Aktivitas esterase protein HE dapat membelah asam sialic dari rantai gula, yang dapat membantu virus melarikan diri dari sel di mana ia direplikasi. Antibodi terhadap protein HE juga dapat menetralisir virus.

c)      M (membran) protein

M membrane protein yang berasal  glikoprotein membran-spanning lain tapi sebagian besar protein internal dengan hanya domain N-terminal eksternal kecil. Protein M meliputi membran virus. Protein ini membantu  dalam pembentukan  nukleokapsid ke membran struktur internal seperti Badan Golgi .Protein ini dan tidak ditemukan pada membran plasma sel (seperti glikoprotein lain)

d)     E (amplop) protein (9-12kD)

Merupakan jenis  protein kecil ini yang ada  pada membran virus. Tepatnya berada di dalam sel yang terinfeksi dan ditemukan pila di sekitar inti  pada permukaan sel.

e)       Nukleokapsid  protein (60kD)

Protein nukleokapsid mengikat RNA genomik secara berurutan , selain itu  protein M pada permukaan bagian dalam membran virus juga diikat. Protein N telah terfosforilasi. Tidak seperti virus RNA lain, yang mana coronavirus tidak memasukkan polimerase RNA ke dalam partikel virus; tetapi polimerase dibuat setelah terjadi infeksi dengan menggunakan sense RNA genom positif sebagai mRNA. Hal ini dimungkinkan karena gen pol adalah pada ujung 5 'genom.